RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DGAT1O75907 488 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 UPP2O95045 317 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PCK1P35558 622 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PEX19P40855 299 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PLCB3Q01970 1234 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PAFAH2Q99487 392 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 FETUBQ9UGM5 382 aa15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 LRRD1A4D1F6 860 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PSMC4P43686 418 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DGKZQ13574 1117 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PYROXD1Q8WU10 500 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DPPA5A6NC42 116 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 GOLGA8RI6L899 631 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ACADSP16219 412 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ATP4AP20648 1035 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PHBP35232 272 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 GDF10P55107 478 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DLGAP5Q15398 846 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 BANPQ8N9N5 519 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CPT1BQ92523 772 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PTPRN2Q92932 1015 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.69■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 NDC80O14777 642 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ZNF132P52740 706 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 STYK1Q6J9G0 422 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PCGF5Q86SE9 256 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 H0YIN7 160 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CLGNO14967 610 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 TM9SF1O15321 606 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ASNSP08243 561 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PDHA1P08559 390 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 BAG6P46379 1132 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 ARL4CP56559 192 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 RHPN2Q8IUC4 686 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PPIL6Q8IXY8 311 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 VPS11Q9H270 941 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CYP26B1Q9NR63 512 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 STK32BQ9NY57 414 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 HEY2Q9UBP5 337 aa15.68■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 A0A0G2JND7 137 aa15.67■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CFAP69A5D8W1 941 aa15.67■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CCDC22O60826 627 aa15.67■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 CALB1P05937 261 aa15.67■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.67■□□□□ 0.1
SYP-201ENST00000263233 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms