RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 STK24Q9Y6E0 443 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 HDAC4P56524 1084 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 RFX8Q6ZV50 586 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ACAD11Q709F0 780 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 SV2BQ7L1I2 683 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 CRABP2P29373 138 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PSMD7P51665 324 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ARFIP2P53365 341 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 DDX12PQ92771 950 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 COL6A2P12110 1019 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KRT13P13646 458 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ITGA9Q13797 1035 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KCTD2Q14681 263 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 UNC13DQ70J99 1090 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 FNDC8Q8TC99 324 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 NAGPAQ9UK23 515 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 UNCXA6NJT0 531 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PLA2G4BP0C869 781 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 RPA1P27694 616 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ATP5DP30049 168 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PPP1R2P41236 205 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 HALP42357 657 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ERFP50548 548 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 UGCGQ16739 394 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KSR1Q8IVT5 923 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 SAR1AQ9NR31 198 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 FBXO40Q9UH90 709 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 MAGEB2O15479 319 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC22O60826 627 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PGM3O95394 542 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ANPEPP15144 967 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 HTRA3P83110 453 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 GRM2Q14416 872 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 P4HA2O15460 535 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 USP1O94782 785 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 IL9RQ01113 521 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ARSHQ5FYA8 562 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TBK1Q9UHD2 729 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 SFI1A8K8P3 1242 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 SLC25A27O95847 323 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 STXBP2Q15833 593 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 AADACL2Q6P093 401 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 TTC27Q6P3X3 843 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 AMFRQ9UKV5 643 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 MCM3APO60318 1980 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC13-201ENST00000243056 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms