RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC189A1A4V9 331 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD17O75943 681 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDCD1Q96RS6 583 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 HAUS1Q96CS2 278 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSS3Q9H6R3 686 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 A6NHS1 94 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 TM9SF1O15321 606 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD23BP54727 409 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 SPDL1Q96EA4 605 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS11Q9H270 941 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0B4J269 797 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRD1A4D1F6 860 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 E7ESA3 106 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 BANF1O75531 89 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 RGS20O76081 388 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ADRA1DP25100 572 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC25CP30307 473 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ARL4CP56559 192 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCB3Q01970 1234 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 DGKZQ13574 1117 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 NCOA4Q13772 614 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 TFDP1Q14186 410 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 EMC2Q15006 297 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 XKR3Q5GH77 459 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CPT1BQ92523 772 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 NPHS2Q9NP85 383 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 IFNB1P01574 187 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 BANPQ8N9N5 519 aa23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 SSTR1P30872 391 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 PAFAH2Q99487 392 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MARK3P27448 753 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MTERF2Q49AM1 385 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MSS51Q4VC12 460 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TSHRP16473 764 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 NAMPTP43490 491 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTR2P61160 394 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 GAD2Q05329 585 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TCP10LQ8TDR4 215 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF146Q9NTX7 359 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIK3Q13003 919 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 PORCNQ9H237 461 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms