RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam122aQ9DB52 284 aa21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim54Q9ERP3 366 aa21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt17Q9QWL7 433 aa21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnajb7Q9QYI8 312 aa21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pck1Q9Z2V4 622 aa21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp34Q6ZQ93 3582 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm3371F7CQW8 167 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Edil3O35474 480 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PdgfraP26618 1089 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ugt1a2P70691 533 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5168Q4KL04 211 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm4952Q5FW57 296 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Traf3Q60803 567 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ugt1a1Q63886 535 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpr151Q7TSN6 422 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Micall1Q8BGT6 870 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Anapc5Q8BTZ4 740 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nlrp4aQ8BU40 982 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ago3Q8CJF9 860 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ace2Q8R0I0 805 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Them5Q9CQJ0 248 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mageb3Q9D2H4 330 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GOLGA7BQ9D428 167 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rabl3Q9D4V7 236 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Capn12Q9ER56 720 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cops2P61202 443 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppm1jQ149T7 507 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PostnQ62009 838 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Oca2Q62052 833 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klra3Q64329 266 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp2c29Q64458 490 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxw21Q8BI38 468 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Uba3Q8C878 462 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcdhb1Q91Y08 818 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nxnl2Q9D531 156 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cpb2Q9JHH6 422 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trpv2Q9WTR1 756 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SrcapA0A087WQ44 3271 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm3415J3QMS8 315 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif2aP28740 705 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppm1aP49443 382 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rsad2Q8CBB9 362 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 McmbpQ8R3C0 642 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eps8l2Q99K30 729 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NamptQ99KQ4 491 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm3404Q9D506 307 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cetn2Q9R1K9 172 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 St6galnac4Q9R2B6 360 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cntnap4Q99P47 1310 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam81bA0A140LI28 432 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PrkchP23298 683 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sox8Q04886 464 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Acsbg2Q2XU92 667 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mtus1Q5HZI1 1210 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GopcQ8BH60 463 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Timd2Q8R183 305 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Isl2Q9CXV0 359 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lipo2D3YY49 398 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Akr1b10G5E895 316 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ChkbO55229 394 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01644 108 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01645 108 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01646 108 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01647 108 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc134Q8C7V8 229 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Actl9Q8CG27 415 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm281D3Z1Y0 860 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mroh4G3X8W1 983 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Glud1P26443 558 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ercc5P35689 1170 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zscan2Q07230 614 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CochQ62507 552 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 LnpkQ7TQ95 425 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GnsQ8BFR4 544 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map2k5Q9WVS7 448 aa21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DgkiD3YWQ0 1071 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem265E9Q8G3 109 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp358E9Q8M1 571 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.9 ms