RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 TMC2Q8TDI7 906 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 GDE1Q9NZC3 331 aa22.59■■□□□ 1.21
SNAP23-216ENST00000568331 TECTAO75443 2155 aa22.59■■□□□ 1.21
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SNAP23-216ENST00000568331 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.58■■□□□ 1.21
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SNAP23-216ENST00000568331 MICAL2O94851 1124 aa22.57■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 ASIC4Q96FT7 647 aa22.57■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.57■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 GABRDO14764 452 aa22.56■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.56■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 FAM163BP0C2L3 166 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 SYT15Q9BQS2 421 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.55■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 PDGFRBP09619 1106 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 SRFP11831 508 aa22.54■■□□□ 1.2
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SNAP23-216ENST00000568331 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 CCR2P41597 374 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 FBXL6Q8N531 539 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 GIPC2Q8TF65 315 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP23-216ENST00000568331 ABCB6Q9NP58 842 aa22.54■■□□□ 1.2
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