RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470463.1

SND1-208, Transcript of staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, human

TSL 4

Gene SND1, Length 530 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SND1-208	ENST00000470463	RWDD2B	P57060	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	CAP1	Q01518	475 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	PTP4A2	Q12974	167 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	BFSP2	Q13515	415 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	MESD	Q14696	234 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	ACAP1	Q15027	740 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	ZNF394	Q53GI3	561 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SND1-208	ENST00000470463	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	EOMES	O95936	686 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	COMT	P21964	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	RRM1	P23921	792 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CXCR5	P32302	372 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	GABRB2	P47870	512 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	NDST1	P52848	882 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	SLC8A3	P57103	927 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	DSC3	Q14574	896 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	LPIN1	Q14693	890 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CD101	Q93033	1021 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463		H0YGN5	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463		O00370	1275 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	INPPL1	O15357	1258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PROSC	O94903	275 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	GHR	P10912	638 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CKB	P12277	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CD52	P31358	61 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	LHX1	P48742	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CDH8	P55286	799 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	GRIK3	Q13003	919 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PASD1	Q8IV76	773 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	DPF3	Q92784	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	APBB2	Q92870	758 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PSMB7	Q99436	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SND1-208	ENST00000470463	RSAD1	Q9HA92	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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