RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 TIPINQ9BVW5 301 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PIDD1Q9HB75 910 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CREB3O43889 395 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 HBP1O60381 514 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 GJB1P08034 283 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 RFC5P40937 340 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 RANBP1P43487 201 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 IL9RQ01113 521 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ANO5Q75V66 913 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 RNF180Q86T96 592 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 TPH2Q8IWU9 490 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ARRDC4Q8NCT1 418 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 GDAP1Q8TB36 358 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PHF24Q9UPV7 400 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 USP20Q9Y2K6 914 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MAGEA13PA6NCF6 341 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MYADML2A6NDP7 307 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 H3BRB1 525 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 UPP2O95045 317 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PLA2G4BP0C869 781 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 BRAFP15056 766 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC9A1P19634 815 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PON1P27169 355 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 STAT1P42224 750 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PSMC6P62333 389 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC6Q16204 474 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MAIP1Q8WWC4 291 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNN1Q92952 543 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM136AQ96C01 138 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 GBP5Q96PP8 586 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 VCX3BQ9H321 246 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PDP2Q9P2J9 529 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 E9PMD0 336 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SETSIPP0DME0 302 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CTNNA2P26232 953 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ADAM17P78536 824 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SP4Q02446 784 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MGAT5Q09328 741 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CALCOCO2Q13137 446 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 BORCS6Q96GS4 357 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MTUS1Q9ULD2 1270 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MCM3APO60318 1980 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SORBS3O60504 671 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PGK1P00558 417 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CYP11B2P19099 503 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PSEN2P49810 448 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms