RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 AKAP3O75969 853 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 KRT13P13646 458 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 VAMP7P51809 220 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 MYL6P60660 151 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 LRRC63Q05C16 580 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 STIM1Q13586 685 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 FAM171BQ6P995 826 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 MTSS1LQ765P7 747 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 SV2AQ7L0J3 742 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ITFG1Q8TB96 612 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 PSMG2Q969U7 264 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 PKMYT1Q99640 499 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 CORO1BQ9BR76 489 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 CDH9Q9ULB4 789 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 CITO14578 2027 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 TMEM221A6NGB7 291 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 M0R296 226 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 PSMA7O14818 248 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 STX10O60499 249 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ASGR2P07307 311 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 MAGEA11P43364 429 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 BIRC3Q13489 604 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 HTR4Q13639 388 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 NCOA4Q13772 614 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 VEPH1Q14D04 833 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ASIC4Q96FT7 647 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 FAM84AQ96KN4 292 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 MMS19Q96T76 1030 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 TSG101Q99816 390 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 LRRC3Q9BY71 257 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ASAH2Q9NR71 780 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 WNT16Q9UBV4 365 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.78□□□□□ -0.52
PDCL-202ENST00000394285 SOBPA7XYQ1 873 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 ECI2O75521 394 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SRFP11831 508 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 P4HA1P13674 534 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 CCNE1P24864 410 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 TNNC1P63316 161 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 DLG4P78352 724 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 OSTM1Q86WC4 334 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 E2F7Q96AV8 911 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 KCNH6Q9H252 994 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SNX25Q9H3E2 840 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.77□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 MOSPD3O75425 235 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 VNN1O95497 513 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 CSH1P0DML2 217 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 CSH2P0DML3 217 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 LMO2P25791 158 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 WEE1P30291 646 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 CCR2P41597 374 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 MORC3Q14149 939 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 ZNF699Q32M78 642 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 VSTM1Q6UX27 236 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 TMC8Q8IU68 726 aa11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PDCL-202ENST00000394285 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms