RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369466.8

TTF2-201, Transcript of transcription termination factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTF2, Length 9,462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2-201ENST00000369466 MSANTD3Q96H12 275 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CD300AQ9UGN4 299 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SYNMO15061 1565 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PER2O15055 1255 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 XKR9Q5GH70 373 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HPF1Q9NWY4 346 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ANXA6P08133 673 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HAAOP46952 286 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 GPR85P60893 370 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 RAPSNQ13702 412 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 OCLNQ16625 522 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 TTC27Q6P3X3 843 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PALB2Q86YC2 1186 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 KCNK13Q9HB14 408 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PIGUQ9H490 435 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 DEPDC5O75140 1603 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PEX1O43933 1283 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 TRIM49P0CI25 452 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 TRIM49CP0CI26 452 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 NPR3P17342 541 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CDC27P30260 824 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 RAB25P57735 213 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PPP2R2BQ00005 443 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CD83Q01151 205 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 C12orf60Q5U649 245 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SVIPQ8NHG7 77 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MUC3BQ9H195 1237 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 AFF2P51816 1311 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 A0A1W2PQ27 194 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 A0A1W2PQ64 194 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 A0A1W2PQD8 194 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 BMP10O95393 424 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PDE6AP16499 860 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ATP6V0D1P61421 351 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 STX4Q12846 297 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 AP3B2Q13367 1082 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 LSAMPQ13449 338 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CAMK1Q14012 370 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PCSK7Q16549 785 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MPP7Q5T2T1 576 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SULF1Q8IWU6 871 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 RICTORQ6R327 1708 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MROH2AA6NES4 1674 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 APOC1P02654 83 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 VEPH1Q14D04 833 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 VWA3BQ502W6 1294 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 RELTQ969Z4 430 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.35□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 GNA11P29992 359 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 PRKCQQ04759 706 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 CD302Q8IX05 232 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 FANK1Q8TC84 345 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 DACH2Q96NX9 599 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 TM9SF2Q99805 663 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 GPR108Q9NPR9 543 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 FLT1P17948 1338 aa6.34□□□□□ -1.39
TTF2-201ENST00000369466 STAT3P40763 770 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms