RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 WDR93Q6P2C0 686 aa20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CCDC66A2RUB6 948 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CCDC151A5D8V7 595 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 O00370 1275 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SPTLC1O15269 473 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MICAL2O94851 1124 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CTNNA2P26232 953 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SLC1A1P43005 524 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MARCKSL1P49006 195 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 VSNL1P62760 191 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.33■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MLH1P40692 756 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TAF6P49848 677 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DPH6Q7L8W6 267 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.33■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MGEA5O60502 916 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CAND2O75155 1236 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PROSCO94903 275 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 FGGP02679 453 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LRPAP1P30533 357 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LPPQ93052 612 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GAD1Q99259 594 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SQORQ9Y6N5 450 aa20.32■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 M0QYV0 167 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 KRIT1O00522 736 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ZNF623O75123 536 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GJB6O95452 261 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CKBP12277 381 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GPD2P43304 727 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 SV2CQ496J9 727 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 C8orf74Q6P047 294 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 UNC93AQ86WB7 457 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 C12orf29Q8N999 325 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 THP07101 528 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MCM3P25205 808 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 RAB27AP51159 221 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LILRA4P59901 499 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DSC3Q14574 896 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CLUL1Q15846 466 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ACOT1Q86TX2 421 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 C3orf20Q8ND61 904 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 CPXM1Q96SM3 734 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 KRT12Q99456 494 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 NME7Q9Y5B8 376 aa20.31■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 A0A0U1RQF3 1178 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ARL5CA6NH57 179 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 A8MXQ7 604 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 RWDD2BP57060 319 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 STILQ15468 1287 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 APPL2Q8NEU8 664 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 UBA3Q8TBC4 463 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 C18orf8Q96DM3 657 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 ADAM2Q99965 735 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 PHF24Q9UPV7 400 aa20.3■□□□□ 0.84
UPP1-201ENST00000331803 KBTBD13C9JR72 458 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms