RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.06■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SH3PXD2BA1X283 911 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NDC80O14777 642 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 TBX3O15119 743 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G6O60733 806 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RPL5P46777 297 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LDHDQ86WU2 507 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 WDR18Q9BV38 432 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 EBF3Q9H4W6 596 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 VAV3Q9UKW4 847 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.05■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MEIS1O00470 390 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 C2CD2LO14523 706 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 S100A1P23297 94 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 COASYQ13057 564 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CASP10Q92851 521 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 GLG1Q92896 1179 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 VPS50Q96JG6 964 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FEM1BQ9UK73 627 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 GYG2O15488 501 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NOL4O94818 638 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 COL6A2P12110 1019 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FAM160B2Q86V87 743 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NDE1Q9NXR1 346 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.04■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 POLR2MP0CAP2 368 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZNF76P36508 570 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ARPC4P59998 168 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RPL26P61254 145 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ASPHQ12797 758 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZNF536O15090 1300 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 EML1O00423 815 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FBP2O00757 339 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 EDF1O60869 148 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PHF2O75151 1096 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CLCN2P51788 898 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PTPROQ16827 1216 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ARSHQ5FYA8 562 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 GPBP1Q86WP2 473 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 VPS52Q8N1B4 723 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZNF398Q8TD17 642 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FAM20AQ96MK3 541 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 WRNIP1Q96S55 665 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 DMTF1Q9Y222 760 aa23.03■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 GAS8O95995 478 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MUTP22033 750 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PTGIRP43119 386 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SLC12A3P55017 1021 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LPIN1Q14693 890 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 CLUL1Q15846 466 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 SFR1Q86XK3 245 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 EURLQ9NYK6 297 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PODXLO00592 558 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ADCY3O60266 1144 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 RAP1GDS1P52306 607 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 NPEPPSP55786 919 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PDSS2Q86YH6 399 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.02■■□□□ 1.28
PITX1-201ENST00000265340 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 PLCB3Q01970 1234 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 CYP4A11Q02928 519 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC3Q13217 504 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 TRAF5O00463 557 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 TCEA3O75764 348 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 SMIM18P0DKX4 95 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 UQCRBP14927 111 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 RPA1P27694 616 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 CAMK2BQ13554 666 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 ASIC2Q16515 512 aa23.01■■□□□ 1.27
PITX1-201ENST00000265340 DCAF15Q66K64 600 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms