RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43	4e-8	■□□□□ 8.6
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	POM121B	A6NF01	834 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	UNC5C	O95185	931 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ITGB1	P05556	798 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	IDE	P14735	1019 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	NHLH2	Q02577	135 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CTBP1	Q13363	440 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	NFIX	Q14938	502 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	IQCB1	Q15051	598 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM209B	Q5JX69	171 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	METRNL	Q641Q3	311 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	POC1B	Q8TC44	478 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SPSB4	Q96A44	273 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SNX22	Q96L94	193 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	APOL5	Q9BWW9	433 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	XPR1	Q9UBH6	696 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	HESX1	Q9UBX0	185 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1B0GTW7	788 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1W2PS29	197 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830		K7ESM1	405 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	APOL1	O14791	398 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ADAMTS3	O15072	1205 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MT-ND5	P03915	603 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MYL4	P12829	197 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KCNA2	P16389	499 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	HK1	P19367	917 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	BMPR1A	P36894	532 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	JAG1	P78504	1218 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLFN5	Q08AF3	891 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MZT2A	Q6P582	158 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RNF44	Q7L0R7	432 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SYT12	Q8IV01	421 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MB21D1	Q8N884	522 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PDPR	Q8NCN5	879 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMIE	Q8NEW7	156 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	DEF6	Q9H4E7	631 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CERS4	Q9HA82	394 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	AQP7P3	A6NL99	342 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KPNA5	O15131	536 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CFI	P05156	583 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MYL3	P08590	195 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FGFR2	P21802	821 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	LOXL3	P58215	753 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TNFAIP2	Q03169	654 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CRHR2	Q13324	411 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RABL3	Q5HYI8	236 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CHST13	Q8NET6	341 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MAML1	Q92585	1016 aa		6.06	□□□□□ -1.44

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