RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 HHIPQ96QV1 700 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 LAMA3Q16787 3333 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ANK1P16157 1881 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 A0A1B0GUA9 196 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 H3BRJ5 948 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 FAM189A1O60320 539 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TSPAN1O60635 241 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FGFR4P22455 802 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AXLP30530 894 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CYP2J2P51589 502 aa6.66□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 MCL1Q07820 350 aa6.66□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 Q6ZS46 218 aa6.66□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FAM228AQ86W67 206 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GPD1LQ8N335 351 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 BICD1Q96G01 975 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TOX2Q96NM4 488 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 INTS13Q9NVM9 706 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 IFNKQ9P0W0 207 aa6.66□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 M0QZ92 97 aa6.65□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 OGTO15294 1046 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CLDN3O15551 220 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TEX33O43247 280 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 EXTL3O43909 919 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 EXOC3O60645 756 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ERLIN2O94905 339 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 WISP1O95388 367 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ADCY5O95622 1261 aa6.65□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 ADRB2P07550 413 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MCF2P10911 925 aa6.65□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 THPOP40225 353 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PBX1P40424 430 aa6.65□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 TLE2Q04725 743 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ENPEPQ07075 957 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 LPIN1Q14693 890 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GPNMBQ14956 572 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MAN2A1Q16706 1144 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 VWA3BQ502W6 1294 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.65□□□□□ -1.34
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