RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516721.1

RNU6-965P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 965, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-965P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-965P-201ENST00000516721 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SYT5O00445 386 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIM24O15164 1050 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 KCNQ3O43525 872 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SH3BP5O60239 455 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 B4GALT3O60512 393 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 RASSF9O75901 435 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 UNC5CO95185 931 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 C1QTNF9P0C862 333 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ABCB4P21439 1286 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 FPR1P21462 350 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ACVR2AP27037 513 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ALDH9A1P49189 494 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC11A2P49281 568 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ARL4CP56559 192 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 RPS16P62249 146 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ARHGEF7Q14155 803 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 PTK2BQ14289 1009 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 IQCB1Q15051 598 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 RALBP1Q15311 655 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 TBR1Q16650 682 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 MPEG1Q2M385 716 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 MRNIPQ6NTE8 343 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 HTR3DQ70Z44 454 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 MICU3Q86XE3 530 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SIAH1Q8IUQ4 282 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 RHOT2Q8IXI1 618 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 VGLL2Q8N8G2 317 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 TEX19Q8NA77 164 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 OR52N2Q8NGI0 321 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 FAM71BQ8TC56 605 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 STON2Q8WXE9 905 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 CEP95Q96GE4 821 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 NT5C1BQ96P26 610 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 RMDN3Q96TC7 470 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SYT3Q9BQG1 590 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 C1orf43Q9BWL3 253 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPON1Q9HCB6 807 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 CASS4Q9NQ75 786 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 HELLSQ9NRZ9 838 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 PLA2G3Q9NZ20 509 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 XPR1Q9UBH6 696 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC23A1Q9UHI7 598 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZMYM3Q14202 1370 aa2.65□□□□□ -1.98
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 COQ9O75208 318 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 AGFG2O95081 481 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 PLATP00750 562 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 AHSGP02765 367 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 KRT1P04264 644 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 ITGA2BP08514 1039 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 TPH1P17752 444 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 HDCP19113 662 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 ITGALP20701 1170 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CHKAP35790 457 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CPT1AP50416 773 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 RAP2BP61225 183 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CTBP1Q13363 440 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 PMS2P11Q13670 270 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 PRKG1Q13976 671 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPDYE7PQ495Y7 208 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 NT5DC1Q5TFE4 455 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 TANGO2Q6ICL3 276 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 GLB1LQ6UWU2 654 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CLNKQ7Z7G1 428 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 TAX1BP1Q86VP1 789 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 GPR135Q8IZ08 494 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-965P-201ENST00000516721 MPP5Q8N3R9 675 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms