RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	BORCS6	Q96GS4	357 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	BRD9	Q9H8M2	597 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	AMPD3	Q01432	767 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM209	Q96SK2	561 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	TSC2	P49815	1807 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SNF8-208	ENST00000510195	MAN2B1	O00754	1011 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	EXTL3	O43909	919 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TEAD2	Q15562	447 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	E2F4	Q16254	413 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	VIT	Q6UXI7	678 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	CLDN23	Q96B33	292 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	CUTA	O60888	179 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	GJA1	P17302	382 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SAAL1	Q96ER3	474 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	F5	P12259	2224 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195		A0A1W2PRU2	124 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	LRRN2	O75325	713 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SP9	P0CG40	484 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	GRM2	Q14416	872 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	VEPH1	Q14D04	833 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	WSCD1	Q658N2	575 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	IQUB	Q8NA54	791 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TCHH	Q07283	1943 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	CD72	P21854	359 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	WEE1	P30291	646 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	VIPR2	P41587	438 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	GPD1L	Q8N335	351 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SPATA18	Q8TC71	538 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TRIM9	Q9C026	710 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF263	O14978	683 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	GDI1	P31150	447 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ATL3	Q6DD88	541 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	GAREM2	Q75VX8	874 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	HSCB	Q8IWL3	235 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	LAMTOR5	O43504	91 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ITGB3	P05106	788 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	WNT7B	P56706	349 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	TSPY1	Q01534	308 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SURF1	Q15526	300 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	OBP2A	Q9NY56	170 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNF8-208	ENST00000510195	SHISA7	A6NL88	538 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SNF8-208	ENST00000510195	CHAD	O15335	359 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SNF8-208	ENST00000510195	HUS1	O60921	280 aa		28.7	■■■□□ 2.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms