RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 INCA1Q0VD86 236 aa23.51■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 ORC1Q13415 861 aa23.51■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.51■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.51■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.51■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.5■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.5■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 TWNKQ96RR1 684 aa23.49■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.49■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 ACOT1Q86TX2 421 aa23.47■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF677Q86XU0 584 aa23.47■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.47■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.47■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.47■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 TNIP3Q96KP6 325 aa23.47■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 MARCH5Q9NX47 278 aa23.47■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.47■■□□□ 1.35
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PSPC1-204ENST00000492741 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.46■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.46■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.46■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 FUT10Q6P4F1 479 aa23.46■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.46■■□□□ 1.35
PSPC1-204ENST00000492741 DESI2Q9BSY9 194 aa23.46■■□□□ 1.35
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