RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ROR1	Q01973	937 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	RAB33A	Q14088	237 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	HLA-C	Q95604	372 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	P4HA2	O15460	535 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	LRRN2	O75325	713 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	GLP2R	O95838	553 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CDH8	P55286	799 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TSPY1	Q01534	308 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	COG5	Q9UP83	839 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019		A8MXQ7	604 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	GABRD	O14764	452 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PMM2	O15305	246 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TBX10	O75333	385 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TACC1	O75410	805 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	KCNA5	P22460	613 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PCSK1	P29120	753 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LRMP	Q12912	555 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	KCNC3	Q14003	757 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	NCAPH	Q15003	741 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TATDN2	Q93075	761 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	SZT2	Q5T011	3432 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	PRRG1	O14668	218 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	HCRT	O43612	131 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	C1R	P00736	705 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LMO2	P25791	158 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LTBR	P36941	435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TPM4	P67936	248 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	GPR17	Q13304	367 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	CLUL1	Q15846	466 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	VPS16	Q9H269	839 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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