RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, human

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HMG20B-209	ENST00000470356	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	IRF7	Q92985	503 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SNX21	Q969T3	373 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	PSMG2	Q969U7	264 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SAAL1	Q96ER3	474 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356		A0A1W2PRU2	124 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	KPNA7	A9QM74	516 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SP9	P0CG40	484 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	VIPR2	P41587	438 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	MAGEA9	P43362	315 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SV2C	Q496J9	727 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	WSCD1	Q658N2	575 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	E2F7	Q96AV8	911 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	CLDN23	Q96B33	292 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TMEM206	Q9H813	350 aa		33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	PPP6R2	O75170	966 aa		33.8	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	WNT7B	P56706	349 aa		33.8	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SMARCB1	Q12824	385 aa		33.8	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ITIH5	Q86UX2	942 aa		33.8	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF560	Q96MR9	790 aa		33.8	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		33.8	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SHISA7	A6NL88	538 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	NCAM2	O15394	837 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SOAT2	O75908	522 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	FGF19	O95750	216 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	GDI1	P31150	447 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	PNPLA4	P41247	253 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TNMD	Q9H2S6	317 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	PATJ	Q8NI35	1801 aa		33.79	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	E2F4	Q16254	413 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	GAREM2	Q75VX8	874 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	CUEDC2	Q9H467	287 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356		R4GN57	208 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		33.78	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	MAN2B1	O00754	1011 aa		33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	EXTL3	O43909	919 aa		33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	YEATS4	O95619	227 aa		33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	ADSSL1	Q8N142	457 aa		33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	COL4A2	P08572	1712 aa		33.76	■■■■□ 3
HMG20B-209	ENST00000470356	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		33.76	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF263	O14978	683 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	LAMTOR5	O43504	91 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	CUTA	O60888	179 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	ITGB3	P05106	788 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	FZD5	Q13467	585 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	VEPH1	Q14D04	833 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	NCAN	O14594	1321 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	ATF6	P18850	670 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	GABRR2	P28476	465 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	AMPD3	Q01432	767 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HMG20B-209	ENST00000470356	CXorf38	Q8TB03	319 aa		33.74	■■■□□ 2.99

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