RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445706.5

PACSIN2-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2, human

TSL 5

Gene PACSIN2, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN2-208	ENST00000445706	PSMG2	Q969U7	264 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TBX20	Q9UMR3	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCL26	Q9Y258	94 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706		A0A087WWV3	80 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TK2	O00142	265 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	OPHN1	O60890	802 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SOAT2	O75908	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	FGF19	O95750	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CFI	P05156	583 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	LIG1	P18858	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ALDH1A3	P47895	512 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	AMPD2	Q01433	879 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	PSMD2	Q13200	908 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	AAMP	Q13685	434 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CEP120	Q8N960	986 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	RIN3	Q8TB24	985 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	BSND	Q8WZ55	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ASB3	Q9Y575	518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	TSC2	P49815	1807 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MCM4	P33991	863 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	GJA4	P35212	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	RNF20	Q5VTR2	975 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CENPP	Q6IPU0	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	POTED	Q86YR6	584 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	RASEF	Q8IZ41	740 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	FRMD1	Q8N878	549 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	RLN3	Q8WXF3	142 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	IL21	Q9HBE4	155 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPTA1	P02549	2419 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706		A0A087WV48	116 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SH3BP5	O60239	455 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MARCH6	O60337	910 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	OAZ2	O95190	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CPA1	P15085	419 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	IFNAR1	P17181	557 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ITPKA	P23677	461 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	P2RY2	P41231	377 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	GPR17	Q13304	367 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	BRF1	Q92994	677 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	CD101	Q93033	1021 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PACSIN2-208	ENST00000445706	MTMR11	A4FU01	709 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	MAP3K13	O43283	966 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	GRM5	P41594	1212 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PACSIN2-208	ENST00000445706	OSTN	P61366	133 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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