RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 PNMA3Q9UL41 463 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NR2E1Q9Y466 385 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 FDX1P10109 184 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RABGGTBP53611 331 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 AGAP11Q8TF27 550 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF516Q92618 1163 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 SNX24Q9Y343 169 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 LTBP1Q14766 1721 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TMCC1O94876 653 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GNA15P30679 374 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MAPK4P31152 587 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGEA8P43361 318 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GTF2BQ00403 316 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NAB2Q15742 525 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF699Q32M78 642 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NETO2Q8NC67 525 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM11Q96F44 468 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ZWILCHQ9H900 591 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.1□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CXCL11O14625 94 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TTI1O43156 1089 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 BAG2O95816 211 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ITGB3P05106 788 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RARBP10826 455 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CETPP11597 493 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 COMTP21964 271 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RRM1P23921 792 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GTF2H1P32780 548 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RFC5P40937 340 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 SLCO1A2P46721 670 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 PPIL2Q13356 520 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR142Q7Z601 462 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR20Q99678 358 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CENPKQ9BS16 269 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 KCND1Q9NSA2 647 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NOD1Q9Y239 953 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 LGALS2P05162 132 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 FESP07332 822 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 GLI1P08151 1106 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP11B1P15538 503 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CTNNA2P26232 953 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 PLTPP55058 493 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MPP3Q13368 585 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM110Q86TL2 294 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 CREG2Q8IUH2 290 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 VPS52Q8N1B4 723 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 EMC1Q8N766 993 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 HASPINQ8TF76 798 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 C17orf50Q8WW18 174 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 MIS12Q9H081 205 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 ALG6Q9Y672 507 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 EVPLQ92817 2033 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ACTBP13-201ENST00000423971 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms