RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNA15P30679 374 aa29.26■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 WSCD1Q658N2 575 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC93AQ86WB7 457 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM28Q9UKQ2 775 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSL6Q9Y581 213 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 I3L4J1 428 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB1P05556 798 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300LGQ6UXG3 332 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIMS2Q7Z4I7 341 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HERC6Q8IVU3 1022 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM176AQ96HP8 235 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MXQ7 604 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 M0QZQ0 153 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFAIP3P21580 790 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPS8L1Q8TE68 723 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF558Q96NG5 402 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPAT1Q99943 283 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP12O43422 761 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD19P15391 556 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD23BP54727 409 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF677Q86XU0 584 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA18Q8TC71 538 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCL3Q9H2J4 239 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACP6Q9NPH0 428 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 AAASQ9NRG9 546 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF11P52732 1056 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF3Q5VWG9 929 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD9BQ6WBX8 426 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGXB4Q9UGU5 601 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.271e-8■■■■■ 60.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TYMPP19971 482 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PBX3P40426 434 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTF1Q14872 753 aa29.22■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC4A11Q8NBS3 891 aa29.22■■■□□ 2.27
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 OVOS1Q6IE37 1185 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT1Q86TX2 421 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLYCTKQ8IVS8 523 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPTLC3Q9NUV7 552 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa29.2■■■□□ 2.26
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