RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DAB2P98082 770 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TRIP10Q15642 601 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP10O43572 662 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA3P22001 575 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PCYT1AP49585 367 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SH3GL3Q99963 347 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS3O75489 264 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 RARBP10826 455 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NEK2P51955 445 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MFN1Q8IWA4 741 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PON1P27169 355 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TBX20Q9UMR3 447 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 KRT72Q14CN4 511 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GJB7Q6PEY0 223 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY3O60266 1144 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TTI2Q6NXR4 508 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TFR2Q9UP52 801 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFRBP09619 1106 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2C8P10632 490 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 AIM2O14862 343 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MSH4O15457 936 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK1P29120 753 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ERFP50548 548 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SV2CQ496J9 727 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GPRASP2Q96D09 838 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SUFUQ9UMX1 484 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF9O43307 516 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GRAP2O75791 330 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 USP33Q8TEY7 942 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.126e-7■■■□□ 15.6
CCSAP-201ENST00000284617 L1RE1Q9UN81 338 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SLC37A4O43826 429 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HBP1O60381 514 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD10P28358 340 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G4AP47712 749 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CUL2Q13617 745 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MICALL2Q8IY33 904 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 CHST13Q8NET6 341 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 GID8Q9NWU2 228 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-201ENST00000284617 TAGAPQ8N103 731 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms