RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 MOCS3O95396 460 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 THP07101 528 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PRLRP16471 622 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX16P57768 344 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 WNT8BQ93098 351 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC23Q9UJX2 597 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0U1RQF3 1178 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PITPNM1O00562 1244 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF4AO95239 1232 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 COL6A1P12109 1028 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNB2P17787 502 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK7P50613 346 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DPH6Q7L8W6 267 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC93AQ86WB7 457 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 APBB2Q92870 758 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0U1RQJ8 604 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 EOMESO95936 686 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CALB1P05937 261 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 WEE2P0C1S8 567 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 VDRP11473 427 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CD19P15391 556 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCB4P21439 1286 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 LRPAP1P30533 357 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 INCA1Q0VD86 236 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM84AQ96KN4 292 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 UROC1Q96N76 676 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAM2Q99965 735 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK14Q9P0G3 267 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF14Q9UBS8 474 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SCINQ9Y6U3 715 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 BUB1O43683 1085 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HUS1O60921 280 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPCQ03188 943 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DSC3Q14574 896 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CLUL1Q15846 466 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CXorf38Q8TB03 319 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF653Q96CK0 615 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX25Q9H3E2 840 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RSAD1Q9HA92 442 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 POLIQ9UNA4 740 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PIRO00625 290 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CILPO75339 1184 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PALMO75781 387 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-212ENST00000591041 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 URGCPQ8TCY9 931 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT8Q92599 483 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS18Q9NS28 235 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TFR2Q9UP52 801 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 KPNA7A9QM74 516 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PAFAH1B1P43034 410 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TAP1Q03518 808 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS6KA1Q15418 735 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SGO2Q562F6 1265 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 DAAM2Q86T65 1068 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 APPL2Q8NEU8 664 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 THAP2Q9H0W7 228 aa24.08■■□□□ 1.45
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