RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASPAP45381 313 aa22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H0YGN5 161 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MED7O43513 233 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STAG3L1P0CL83 205 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FLT3P36888 993 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CETN2P41208 172 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2CD6Q53TS8 623 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASB7Q9H672 318 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFS1Q9Y697 457 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A087WZ62 844 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR25O00155 361 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATICP31939 592 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLTPP55058 493 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRB14Q14449 540 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EMC10Q5UCC4 262 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP120Q8N960 986 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H3BRB1 525 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT19P08727 400 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WEE2P0C1S8 567 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IQCF3P0C7M6 154 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF286BP0CG31 522 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR162Q16538 588 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AMHR2Q16671 573 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR142Q7Z601 462 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EXD1Q8NHP7 514 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LACTBL1A8MY62 500 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAEPP09466 180 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R7Q15435 360 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCO2Q9BYV7 579 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 P4HA1P13674 534 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF844Q08AG5 666 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF394Q53GI3 561 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD16Q68DU8 428 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERICH1Q86X53 443 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAML3Q96JK9 1138 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LHX5Q9H2C1 402 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.64■■□□□ 1.22
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFICP08651 508 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PMS2P54278 862 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLMAPQ14BN4 828 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC38Q5VT99 294 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF410Q86VK4 478 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLRP7Q8WX94 980 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIX4Q9UIU6 781 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GAS8O95995 478 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VTNP04004 478 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms