RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 DEF6Q9H4E7 631 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 TSC2P49815 1807 aa25.08■■□□□ 1.61
CLMN-205ENST00000556416 KCNJ6P48051 423 aa25.08■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.08■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.08■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.08■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TBKBP1A7MCY6 615 aa25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 NDUFA10O95299 355 aa25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 KIF11P52732 1056 aa25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ZNF132P52740 706 aa25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 DESI2Q9BSY9 194 aa25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 CALCAP01258 141 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 PDE6CP51160 858 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TOP1MTQ969P6 601 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 SYT11Q9BT88 431 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 AKR1B10O60218 316 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 CYP11B1P15538 503 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 INCA1Q0VD86 236 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ZNF365Q70YC5 407 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 CILPO75339 1184 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 DGKIO75912 1065 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 B3GAT3O94766 335 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 EPHB4P54760 987 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ZNF394Q53GI3 561 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 HCSTQ9UBK5 93 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 L1RE1Q9UN81 338 aa25.05■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 HUS1O60921 280 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 KIF4AO95239 1232 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 FGBP02675 491 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 BPIFB4P59827 614 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 LRRC43Q8N309 656 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TTC39CQ8N584 583 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 APPL2Q8NEU8 664 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 WHAMMQ8TF30 809 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 HASPINQ8TF76 798 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 DPF3Q92784 378 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 SENP8Q96LD8 212 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 AGPAT1Q99943 283 aa25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 F8W810 466 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 CYB561D2O14569 222 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ANXA13P27216 316 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 GNA15P30679 374 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 OR1G1P47890 313 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TAF3Q5VWG9 929 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 VPS36Q86VN1 386 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TWNKQ96RR1 684 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 A0A087X0T9 212 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ZBBXA8MT70 800 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TACC1O75410 805 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ITGB1P05556 798 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 FAM228BP0C875 321 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 NDST1P52848 882 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 RAD23BP54727 409 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.03■■□□□ 1.6
CLMN-205ENST00000556416 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms