RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 URGCPQ8TCY9 931 aa29.6■■■□□ 2.33
GNPTAB-206ENST00000549940 TSGA10Q9BZW7 698 aa29.6■■■□□ 2.33
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GNPTAB-206ENST00000549940 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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GNPTAB-206ENST00000549940 KRT86O43790 486 aa29.59■■■□□ 2.33
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GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF394Q53GI3 561 aa29.58■■■□□ 2.33
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF662Q6ZS27 426 aa29.58■■■□□ 2.33
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GNPTAB-206ENST00000549940 PDCL3Q9H2J4 239 aa29.58■■■□□ 2.33
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GNPTAB-206ENST00000549940 MMEP08473 750 aa29.57■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 GDAP2Q9NXN4 497 aa29.57■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 KANSL3Q9P2N6 904 aa29.57■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 SCN1AP35498 2009 aa29.57■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 TIMP1P01033 207 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 LILRA4P59901 499 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 ABI1Q8IZP0 508 aa29.56■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 A0A0U1RQJ8 604 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 THAP12O43422 761 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 RAG1P15918 1043 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CHRNB2P17787 502 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CLCNKBP51801 687 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 FMO1Q01740 532 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TUSC3Q13454 348 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 NYAP1Q6ZVC0 841 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 ATRIPQ8WXE1 791 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 UROC1Q96N76 676 aa29.56■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CASTOR2A6NHX0 329 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 KIAA0355O15063 1070 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CILPO75339 1184 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TUBB4AP04350 444 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 FGFR1P11362 822 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 IKBKEQ14164 716 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CLLU1OSQ5K130 101 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 GUCA1BQ9UMX6 200 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TET1Q8NFU7 2136 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TMCO5BA8MYB1 307 aa29.54■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF5CO60282 957 aa29.54■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 HUS1O60921 280 aa29.54■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CALCAP01258 141 aa29.54■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGAP25P42331 645 aa29.54■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 APPL2Q8NEU8 664 aa29.54■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 LACRTQ9GZZ8 138 aa29.54■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TFR2Q9UP52 801 aa29.54■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 RCCD1A6NED2 376 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 SPTLC1O15269 473 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 HOXA2O43364 376 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 H2AFZP0C0S5 128 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TNNT1P13805 278 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TCTN1Q2MV58 587 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 H2AFVQ71UI9 128 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 NENFQ9UMX5 172 aa29.53■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 PJA2O43164 708 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 GZMAP12544 262 aa29.53■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF606Q8WXB4 792 aa29.53■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 NDST1P52848 882 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 RAD23BP54727 409 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 SOWAHAQ2M3V2 549 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TRIM72Q6ZMU5 477 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 DPH6Q7L8W6 267 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 PALB2Q86YC2 1186 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM199Q8N511 208 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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GNPTAB-206ENST00000549940 NT5C1AQ9BXI3 368 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 CACNG4Q9UBN1 327 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
GNPTAB-206ENST00000549940 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-206ENST00000549940 MED7O43513 233 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-206ENST00000549940 RTN2O75298 545 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-206ENST00000549940 TACC1O75410 805 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-206ENST00000549940 PAX3P23760 479 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-206ENST00000549940 TOP6BLQ8N6T0 577 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-206ENST00000549940 WHAMMQ8TF30 809 aa29.51■■■□□ 2.31
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