RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520677.1

MRPL13-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L13, human

TSL 3

Gene MRPL13, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL13-204	ENST00000520677	CHRND	Q07001	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	DGKD	Q16760	1214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PCNT	O95613	3336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ANP32C	O43423	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	TAF5L	O75529	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CRTAM	O95727	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CFB	P00751	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	IL1R1	P14778	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GYPE	P15421	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GNAT2	P19087	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	TM4SF4	P48230	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MAPK7	Q13164	816 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NELL1	Q92832	810 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GRM8	O00222	908 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MTSS1	O43312	755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NHLH1	Q02575	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	UTY	O14607	1347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PLIN1	O60240	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NCR1	O76036	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	C1R	P00736	705 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NAT1	P18440	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PLA2G5	P39877	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	AVPR1B	P47901	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KCNJ4	P48050	445 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NPEPPS	P55786	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KRT40	Q6A162	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms