RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	DPP3	Q9NY33	737 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CETN3	O15182	167 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC26A4	O43511	780 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	GLUD1	P00367	558 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	NR3C1	P04150	777 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ADH1A	P07327	375 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	USP8	P40818	1118 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	GTF2B	Q00403	316 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ARID5A	Q03989	594 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ALCAM	Q13740	583 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A0B4J269	797 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CYB561D2	O14569	222 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	HUS1	O60921	280 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	RFPL2	O75678	378 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	GCLM	P48507	274 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	TNNC1	P63316	161 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	AAK1	Q2M2I8	961 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF394	Q53GI3	561 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SNX27	Q96L92	541 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	FRMD6	Q96NE9	622 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	PLVAP	Q9BX97	442 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	F5	P12259	2224 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CCL16	O15467	120 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CD58	P19256	250 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	PIK3CA	P42336	1068 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF131	P52739	623 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	FOXK2	Q01167	660 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	HYAL1	Q12794	435 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	ORC1	Q13415	861 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	C4orf46	Q504U0	113 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	RTP2	Q5QGT7	225 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SENP8	Q96LD8	212 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MED10	Q9BTT4	135 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SNX25	Q9H3E2	840 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	TEX28	O15482	410 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	EXTL3	O43909	919 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	TAF6	P49848	677 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM193A	P78312	1265 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	MCL1	Q07820	350 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	RNF214	Q8ND24	703 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	APPL2	Q8NEU8	664 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CLVS1-205	ENST00000519846	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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