RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.94□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TRAF5O00463 557 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 MAPK13O15264 365 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 DCTN3O75935 186 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CBX6O95503 412 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 SPDYE6P0CI01 402 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CYP3A7P24462 503 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 PSMC6P62333 389 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CDR2Q01850 454 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 SFR1Q86XK3 245 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 STARD8Q92502 1023 aa8.94□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 PRELID1Q9Y255 219 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TRIM17Q9Y577 477 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 KCNK3O14649 394 aa8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 NAT2P11245 290 aa8.93□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 CDC16Q13042 620 aa8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.93□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.93□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 TGFBIQ15582 683 aa8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.93□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.93□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 A8MXQ7 604 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 RASGRF2O14827 1237 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 MSH4O15457 936 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CFBP00751 764 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM18P0DKX4 95 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TAC1P20366 129 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 PCSK6P29122 969 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF76P36508 570 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 SLC12A3P55017 1021 aa8.92□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 NAA20P61599 178 aa8.92□□□□□ -0.98
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