RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF22Q14807 665 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP9Q49MG5 647 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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RABGGTB-211ENST00000489450 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.09□□□□□ -1.75
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.09□□□□□ -1.75
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RABGGTB-211ENST00000489450 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.09□□□□□ -1.75
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RABGGTB-211ENST00000489450 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.09□□□□□ -1.75
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RABGGTB-211ENST00000489450 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 RSAD1Q9HA92 442 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP72Q9P209 647 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 USP25Q9UHP3 1055 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 CDYLQ9Y232 598 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPRMP28827 1452 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-211ENST00000489450 STRCQ7RTU9 1775 aa4.09□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLIM4O00461 696 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 APAF1O14727 1248 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM24O15164 1050 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0556O60303 1618 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 USP19O94966 1318 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 MYL1P05976 194 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RARBP10826 455 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PEX2P28328 305 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC7A1P30825 629 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNJ5P48544 419 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 NRN1LQ496H8 165 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RABL3Q5HYI8 236 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PDSS2Q86YH6 399 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 PDPRQ8NCN5 879 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP43Q8NDM7 1665 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 RLIMQ9NVW2 624 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCA8O94911 1581 aa4.07□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 DIRC3C9JPN6 131 aa4.07□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 TBX3O15119 743 aa4.07□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-211ENST00000489450 EMC10Q5UCC4 262 aa4.07□□□□□ -1.76
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RABGGTB-211ENST00000489450 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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