RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SHD	Q96IW2	340 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SENP8	Q96LD8	212 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP4	Q96PP9	640 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR88	Q9GZN0	384 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	DPP3	Q9NY33	737 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	POLI	Q9UNA4	740 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	EXTL3	O43909	919 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ECI2	O75521	394 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CPB1	P15086	417 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF6	P49848	677 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PFKP	Q01813	784 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG1	Q07617	926 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS33	Q8NF86	280 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM212A	Q96EL1	285 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		18.67	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC24A	O95486	1093 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF19	O95750	216 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NFIC	P08651	508 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NPR3	P17342	541 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY1	Q08828	1119 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNA1	Q09470	495 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL23	Q86XA0	190 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PAGE5	Q96GU1	130 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF560	Q96MR9	790 aa		18.66	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPP19	P56211	112 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NTHL1	P78549	312 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	EHHADH	Q08426	723 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF15	Q12870	199 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SV2C	Q496J9	727 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPP	Q6IPU0	288 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC13D	Q70J99	1090 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ITFG1	Q8TB96	612 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF14	Q92915	247 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	E2F7	Q96AV8	911 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	BORCS6	Q96GS4	357 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE4B	O95155	1302 aa		18.65	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KPNA7	A9QM74	516 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TISP43	B9A030	160 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTLC1	O15269	473 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP5	P51878	434 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHB3	P54753	998 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD6	P59095	220 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2H	P62256	183 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKCQ	Q04759	706 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD2	Q13200	908 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PARM1	Q6UWI2	310 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SIX5	Q8N196	739 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GPD1L	Q8N335	351 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC1	Q9NV70	894 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB561D2	O14569	222 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM163B	P0C2L3	166 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH1A3	P47895	512 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DPH6	Q7L8W6	267 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		18.63	■□□□□ 0.57

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