RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 IDEP14735 1019 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 GJA1P17302 382 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 PSMC3P17980 439 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 CD72P21854 359 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 CCR2P41597 374 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 STAT6P42226 847 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 RESTQ13127 1097 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 TEAD2Q15562 447 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ITIH5Q86UX2 942 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 YAF2Q8IY57 180 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 E2F7Q96AV8 911 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 CLIC6Q96NY7 704 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ACCSQ96QU6 501 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 DPP3Q9NY33 737 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ASB3Q9Y575 518 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 R4GN57 208 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 PIRO00625 290 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 PPEF2O14830 753 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 IL18RAPO95256 599 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 GCNT3O95395 438 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 FGF19O95750 216 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 GDI1P31150 447 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 TAF6P49848 677 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 EPHA5P54756 1037 aa21.8■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 TAF12Q16514 161 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 CENPPQ6IPU0 288 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 HINFPQ9BQA5 517 aa21.8■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PRU2 124 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 MTMR11A4FU01 709 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 TISP43B9A030 160 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 CYB561D2O14569 222 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ZNF263O14978 683 aa21.79■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ZNF560Q96MR9 790 aa21.79■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.78■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.78■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 PANK2Q9BZ23 570 aa21.78■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 PATJQ8NI35 1801 aa21.78■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 COL4A3Q01955 1670 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 SPTLC1O15269 473 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 KINO60870 393 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 MOSPD3O75425 235 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 CYP11A1P05108 521 aa21.77■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 VIPR2P41587 438 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 STK38Q15208 465 aa21.77■■□□□ 1.08
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ACTB-212ENST00000484841 TMEM209Q96SK2 561 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 TSC2P49815 1807 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-212ENST00000484841 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.76■■□□□ 1.07
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