RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479391.6

ERCC6L2-208, Transcript of ERCC excision repair 6 like 2, human

TSL 1 (best)

Gene ERCC6L2, Length 2,849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC6L2-208	ENST00000479391	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC6L2-208	ENST00000479391	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	FBP2	O00757	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SPOP	O43791	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	LRRN2	O75325	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	DGAT1	O75907	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	F13A1	P00488	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	MYBL1	P10243	752 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	MYL4	P12829	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	TYRP1	P17643	537 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	TFEB	P19484	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PTGS1	P23219	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	TM4SF4	P48230	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PCP4	P48539	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	POU3F4	P49335	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ADCY7	P51828	1080 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	CNGA2	Q16280	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
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ERCC6L2-208	ENST00000479391	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
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ERCC6L2-208	ENST00000479391	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PLIN2	Q99541	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
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ERCC6L2-208	ENST00000479391	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NSD2	O96028	1365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	FANCA	O15360	1455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SYNM	O15061	1565 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
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ERCC6L2-208	ENST00000479391	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
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ERCC6L2-208	ENST00000479391	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ATP5H	O75947	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
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ERCC6L2-208	ENST00000479391	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	NR3C2	P08235	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	VCL	P18206	1134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	CTNNA2	P26232	953 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ACSL1	P33121	698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	GGCX	P38435	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	SLC1A1	P43005	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	PTPN9	P43378	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	IFNAR2	P48551	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	IRAK1	P51617	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	ASPH	Q12797	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	CDC20	Q12834	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	IDI1	Q13907	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	DOC2A	Q14183	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERCC6L2-208	ENST00000479391	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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