RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SCN1AP35498 2009 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TECTAO75443 2155 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 MAPK13O15264 365 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 KINO60870 393 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31D3P0C874 917 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R2P41236 205 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PSMD6Q15008 389 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 NFIL3Q16649 462 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 DPH6Q7L8W6 267 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CYB561D2O14569 222 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PRRG1O14668 218 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CLIC2O15247 247 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 HUS1O60921 280 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 RFPL2O75678 378 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 LRG1P02750 347 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ITGB3P05106 788 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CPB1P15086 417 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TNNI1P19237 187 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CYP2J2P51589 502 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ENPEPQ07075 957 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CYP24A1Q07973 514 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 GPR17Q13304 367 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PLD1Q13393 1074 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ELMOD1Q8N336 334 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 EDAQ92838 391 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 NXPE3Q969Y0 559 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CGRRF1Q99675 332 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 DMAC2Q9NW81 257 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CLUHO75153 1309 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 WDR27A2RRH5 827 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ADAM12O43184 909 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 KRT19P08727 400 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 FAM163BP0C2L3 166 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 GUCY2FP51841 1108 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 RDH13Q8NBN7 331 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 LEMD2Q8NC56 503 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SPATA20Q8TB22 786 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SMARCE1Q969G3 411 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PIEZO1Q92508 2521 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PPEF2O14830 753 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 IKBKBO14920 756 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 SPTLC1O15269 473 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 NR3C1P04150 777 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 WEE2P0C1S8 567 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PRR29P0C7W0 189 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 PTPN2P17706 415 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ATICP31939 592 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 LHX1P48742 406 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 ARPP19P56211 112 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 UBE2HP62256 183 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CLDN10P78369 228 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 STIM1Q13586 685 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 IQCEQ6IPM2 695 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TMC2Q8TDI7 906 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 BORCS6Q96GS4 357 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 MYO10Q9HD67 2058 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 TSC2P49815 1807 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-211ENST00000476336 MICAL2O94851 1124 aa14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms