RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CITO14578 2027 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PAEPP09466 180 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 UBXN11Q5T124 520 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF208Q9H0X6 261 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CISHQ9NSE2 258 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL5P13501 91 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GPC5P78333 572 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 XKR4Q5GH76 650 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RFFLQ8WZ73 363 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 BCO2Q9BYV7 579 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ISCUQ9H1K1 167 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PADI3Q9ULW8 664 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NENFQ9UMX5 172 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 THAP12O43422 761 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 STILQ15468 1287 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SV2CQ496J9 727 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LIN9Q5TKA1 542 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF3Q5VWG9 929 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MNS1Q8NEH6 495 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR24Q96S15 920 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SIX4Q9UIU6 781 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ANK1P16157 1881 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF623O75123 536 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GHRP10912 638 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CKBP12277 381 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GALCP54803 685 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB6Q15916 424 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP112Q8N8E3 955 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB118Q96PH6 123 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 BRCA2P51587 3418 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NCANO14594 1321 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 RCCD1A6NED2 376 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM163BP0C2L3 166 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CD58P19256 250 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 AKAP5P24588 427 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ASPAP45381 313 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 FMO1Q01740 532 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LPIN1Q14693 890 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 MMS19Q96T76 1030 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID3AQ99856 593 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 L2HGDHQ9H9P8 463 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MMEP08473 750 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SELPP16109 830 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 CD52P31358 61 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF6P49848 677 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF132P52740 706 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TCEAL1Q15170 157 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 UBR7Q8N806 425 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 MIS12Q9H081 205 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 HES2Q9Y543 173 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-212ENST00000591041 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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