RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566210.1

BBS2-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-213	ENST00000566210		A0A087X1B8	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210		H3BML4	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	RAMP2	O60895	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SOAT2	O75908	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	AGFG2	O95081	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	GC	P02774	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SBK3	P0C264	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	FCER1A	P12319	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	KCNA2	P16389	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	RAB27A	P51159	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	KIF22	Q14807	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	LNX2	Q8N448	690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MAST3	O60307	1309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	LPXN	O60711	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	TYR	P14679	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	HSPA6	P17066	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	FDXR	P22570	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MAP2K6	P52564	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	HSD11B2	P80365	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PROM1	O43490	865 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ESRRB	O95718	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SRGN	P10124	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	RARB	P10826	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210		A0A088AWK7	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	MATN4	O95460	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	PROZ	P22891	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SEC24C	P53992	1094 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBS2-213	ENST00000566210	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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