RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 ANO9A1A5B4 782 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SPTLC1O15269 473 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GCNT3O95395 438 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 YEATS4O95619 227 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 LRG1P02750 347 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 RHOP08100 348 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CFHP08603 1231 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SRFP11831 508 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CLCN5P51795 746 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 LILRA4P59901 499 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ADCY1Q08828 1119 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM132DQ14C87 1099 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 E2F4Q16254 413 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 C9orf57Q5W0N0 161 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SHC4Q6S5L8 630 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PARM1Q6UWI2 310 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 DSTYKQ6XUX3 929 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SIX5Q8N196 739 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ACCSQ96QU6 501 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 TNMDQ9H2S6 317 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 MAFFQ9ULX9 164 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 EXOC7Q9UPT5 735 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 INSL5Q9Y5Q6 135 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SCN1AP35498 2009 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 USP34Q70CQ2 3546 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 KRBA1A5PL33 1030 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CUTAO60888 179 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 F13A1P00488 732 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CPB1P15086 417 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PTPN2P17706 415 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 TYMPP19971 482 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 POTEHQ6S545 545 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 USP37Q86T82 979 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 FLCNQ8NFG4 579 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GPR152Q8TDT2 470 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SENP8Q96LD8 212 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 VNN2O95498 520 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 OR4Q2P0C623 313 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 AOC1P19801 751 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PAX3P23760 479 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ALCAMQ13740 583 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PKP1Q13835 747 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 OVOS1Q6IE37 1185 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 MTSS1LQ765P7 747 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 NT5DC4Q86YG4 428 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC65Q8IXS2 484 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ING5Q8WYH8 240 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PHOX2BQ99453 314 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM213AQ9BRX8 229 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 TRIM9Q9C026 710 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CUEDC2Q9H467 287 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 DPP3Q9NY33 737 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CEP72Q9P209 647 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 OR6C75A6NL08 312 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PI15O43692 258 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 IL18RAPO95256 599 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 ODC1P11926 461 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GARTP22102 1010 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 MRE11P49959 708 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 WNT7BP56706 349 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 TWF1Q12792 350 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GPR17Q13304 367 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 IQUBQ8NA54 791 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 DHX58Q96C10 678 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 SAAL1Q96ER3 474 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 PGLYRP2Q96PD5 576 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CORO1BQ9BR76 489 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CBWD1Q9BRT8 395 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM206Q9H813 350 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 GDE1Q9NZC3 331 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 CA14Q9ULX7 337 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 H0Y858 1186 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 MICAL2O94851 1124 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAMENP-203ENST00000548391 LDHAP00338 332 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms