RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 CAGE1Q8TC20 777 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SSH3Q8TE77 659 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 RSAD1Q9HA92 442 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFPL1O95159 310 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 IL33O95760 270 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNA2P16389 499 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 TLK1Q9UKI8 766 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD62A6NC57 917 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF10O60809 474 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 MALP21145 153 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC93Q567U6 631 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR16Q569H4 304 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF575Q86XF7 245 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 PDPRQ8NCN5 879 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 C3orf20Q8ND61 904 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 TMIEQ8NEW7 156 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 HEPHQ9BQS7 1158 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 DUSP26Q9BV47 211 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 BRD9Q9H8M2 597 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 INTS13Q9NVM9 706 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 POLHQ9Y253 713 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PS29 197 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 YY2O15391 372 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC157Q569K6 752 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 LNX2Q8N448 690 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX19Q92543 992 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXL20Q96IG2 436 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SMOQ99835 787 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF785A8K8V0 405 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 F2RL2O00254 374 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ORC4O43929 436 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ARIH2O95376 493 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ANXA1P04083 346 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 GJB1P08034 283 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP2C19P33261 490 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 DSC2Q02487 901 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SNAPC2Q13487 334 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 Q8NA96 180 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 RGMAQ96B86 450 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIB1Q96RU8 372 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 PDCP20941 246 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 PHKA1P46020 1223 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 PIK3CGP48736 1102 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 PTH2RP49190 550 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 ANAPC15P60006 121 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 MC2RQ01718 297 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 DYRK1AQ13627 763 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms