RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HBP1-211	ENST00000483809	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	B3GALT2	O43825	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FAM20B	O75063	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	ELANE	P08246	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FAM189B	P81408	668 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	OCA2	Q04671	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	GBX1	Q14549	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	KIF22	Q14807	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PNKP	Q96T60	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809		A0A1B0GTW7	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	MATN4	O95460	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CHEK2	O96017	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	HRG	P04196	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	GNAI3	P08754	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FCER1A	P12319	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	LAG3	P18627	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	TACR2	P21452	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	HTR1B	P28222	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	RAB1A	P62820	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	GNAI1	P63096	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	NOMO3	P69849	1222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	DGCR2	P98153	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PLS1	Q14651	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809		Q8N1X5	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809		Q8NA96	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	HAS1	Q92839	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	NCR1	O76036	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	AGFG2	O95081	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	RARB	P10826	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	FGFR4	P22455	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	GPSM2	P81274	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HBP1-211	ENST00000483809	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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