RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NACC2Q96BF6 587 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 ARMT1Q9H993 441 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 RNF181Q9P0P0 153 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 ARIH2O95376 493 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 AHSGP02765 367 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 GJB1P08034 283 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 GNAI3P08754 354 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 KRT4P19013 534 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 PIK3CGP48736 1102 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 GNAI1P63096 354 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 MXRA7P84157 204 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 PDPRQ8NCN5 879 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 TAAR9Q96RI9 348 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 BRD9Q9H8M2 597 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-210ENST00000472326 ZNF785A8K8V0 405 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 E9PLN8 166 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 PLS1Q14651 629 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CYP2A13Q16696 494 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GEN1Q17RS7 908 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 SLC35A4Q96G79 324 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 WDCPQ9H6R7 721 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 PNPOQ9NVS9 261 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 MATN4O95460 622 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 FSTL1Q12841 308 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GTF2H3Q13889 308 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 Q8NA96 180 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 TSPAN6O43657 245 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ITGAMP11215 1152 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 SCAPQ12770 1279 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GPR149Q86SP6 731 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 DENND1CQ8IV53 801 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 TTPALQ9BTX7 342 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 STAP2Q9UGK3 403 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 BOD1Q96IK1 185 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 FAM167AQ96KS9 214 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 MED15Q96RN5 788 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 UBXN7O94888 489 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 HTR1BP28222 390 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 MC2RQ01718 297 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ZNF844Q08AG5 666 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 KIF22Q14807 665 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 PDSS2Q86YH6 399 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 LCORLQ8N3X6 602 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 AMER2Q8N7J2 671 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 SCAMP4Q969E2 229 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 MRIQ9BWK5 157 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 PIPSLA2A3N6 862 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 H3BML4 177 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-210ENST00000472326 ANXA1P04083 346 aa8.66□□□□□ -1.02
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