RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DPYSL4O14531 572 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ABLIM1O14639 778 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PPEF2O14830 753 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 AXIN1O15169 862 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CLDN3O15551 220 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 HRO43593 1189 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 LILRB5O75023 590 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 SOAT2O75908 522 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 SEC24BO95487 1268 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 VNN2O95498 520 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 NEFLP07196 543 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PLA2G4BP0C869 781 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CXCL8P10145 99 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CHRNB1P11230 501 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MUTP22033 750 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TGM1P22735 817 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PROZP22891 400 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 GABRR2P28476 465 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 HOXC13P31276 330 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 RPL9P32969 192 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TNFSF9P41273 254 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 RPS9P46781 194 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ALDH1A3P47895 512 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CXCL12P48061 93 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TRAPPC10P48553 1259 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CCR3P51677 355 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 EPHB3P54753 998 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 NRLP54845 237 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGAP8P85298 464 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 STRN3Q13033 797 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DUSP4Q13115 394 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MAPK7Q13164 816 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PTGDRQ13258 359 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PLD1Q13393 1074 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 LRRC32Q14392 662 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 GAS6Q14393 721 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PPP2R5DQ14738 602 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 PON2Q15165 354 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC6Q16204 474 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 IL17AQ16552 155 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC10A6Q3KNW5 377 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 STXBP5Q5T5C0 1151 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR158Q5T848 1215 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 KRT79Q5XKE5 535 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MCTP1Q6DN14 999 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 LAIR1Q6GTX8 287 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 RINT1Q6NUQ1 792 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TXNDC11Q6PKC3 985 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DSTYKQ6XUX3 929 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DTHD1Q6ZMT9 781 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 Q6ZS52 159 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CEP68Q76N32 757 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 KCNK18Q7Z418 384 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 USP37Q86T82 979 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TMC8Q8IU68 726 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MAP4K3Q8IVH8 894 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MFSD6LQ8IWD5 586 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TCEAL8Q8IYN2 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF687Q8N1G0 1237 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ATAD1Q8NBU5 361 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM200AQ8TCP9 573 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 GIPC2Q8TF65 315 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 NELL1Q92832 810 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 KIF12Q96FN5 646 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 BORCS6Q96GS4 357 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CHAMP1Q96JM3 812 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DRC1Q96MC2 740 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM209Q96SK2 561 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 LPIN3Q9BQK8 851 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 RTKNQ9BST9 563 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 RAB34Q9BZG1 259 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 HAPLN2Q9GZV7 340 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 DNAJC25Q9H1X3 360 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 CRISPLD1Q9H336 500 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 ATXN3LQ9H3M9 355 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 SEMA4GQ9NTN9 838 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD109B-201ENST00000458961 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms