RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NDUFA10O95299 355 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRT5P13647 590 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASPAP45381 313 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BPIFB4P59827 614 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNNC1P63316 161 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GRIK3Q13003 919 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VPS36Q86VN1 386 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM199Q8N511 208 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 URGCPQ8TCY9 931 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BCO2Q9BYV7 579 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIOSQ9NXC5 875 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.29■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP26A1O43174 497 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF11P52732 1056 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTK2Q05397 1052 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IKBKEQ14164 716 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NAB2Q15742 525 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCTN1Q2MV58 587 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MFSD5Q6N075 450 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC39CQ8N584 583 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBR7Q8N806 425 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCND1Q9NSA2 647 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLIQ9UNA4 740 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LTBP2Q14767 1821 aa16.28■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPEF2O14830 753 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZSCAN12O43309 604 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HOXA2O43364 376 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POMCP01189 267 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC175P0C221 793 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLCN1P35523 988 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAF6P49848 677 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRT83P78385 493 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TUSC3Q13454 348 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPA17Q15506 151 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SV2CQ496J9 727 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM270Q6UE05 265 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UROC1Q96N76 676 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CISHQ9NSE2 258 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRG1Q9Y653 693 aa16.27■□□□□ 0.2
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KPNA7A9QM74 516 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PODXLO00592 558 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LCA5LO95447 670 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PFKMP08237 780 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WEE2P0C1S8 567 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CD58P19256 250 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNFAIP3P21580 790 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PAX3P23760 479 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDE6CP51160 858 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABI1Q8IZP0 508 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MMS19Q96T76 1030 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AGPAT1Q99943 283 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DESI2Q9BSY9 194 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EFCAB14O75071 495 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FGFR1P11362 822 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CSF2RAP15509 400 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP11B1P15538 503 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITGB8P26012 769 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC18A3Q16572 532 aa16.25■□□□□ 0.19
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF677Q86XU0 584 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms