RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 GLRA2P23416 452 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 KRT17Q04695 432 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 KATNAL2Q8IYT4 538 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DCLK3Q9C098 648 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CETPP11597 493 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ATP4AP20648 1035 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 LIG3P49916 1009 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 NOMO3P69849 1222 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CCNG2Q16589 344 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SERPINB12Q96P63 405 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 RASGRF2O14827 1237 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TCEA3O75764 348 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CLTAP09496 248 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 IVDP26440 423 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF8P60827 252 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ZPBP2Q6X784 338 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CAPNS2Q96L46 248 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.29■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TP73O15350 636 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DRD4P21917 467 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ATP5DP30049 168 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ1P48048 391 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 RELL1Q8IUW5 271 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 EXD1Q8NHP7 514 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SEC16BQ96JE7 1060 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 FBXO40Q9UH90 709 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 LCTP09848 1927 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SORBS3O60504 671 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CNPY4Q8N129 248 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CPA5Q8WXQ8 436 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 AZI2Q9H6S1 392 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.28■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 FAM170AA1A519 330 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ASAP2O43150 1006 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SP2Q02086 613 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 NEU2Q9Y3R4 380 aa25.27■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CYP2C8P10632 490 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 GNA15P30679 374 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CETN2P41208 172 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 VEGFBP49765 207 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 EFNA5P52803 228 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 LMNB2Q03252 620 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MAMLD1Q13495 774 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 UBR7Q8N806 425 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 PARVAQ9NVD7 372 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 PDHXO00330 501 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CHN1P15882 459 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ACOT2P49753 483 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ZNF132P52740 706 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CCDC121Q6ZUS5 278 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CPLX4Q7Z7G2 160 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 TMEM143Q96AN5 459 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 CABS1Q96KC9 395 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 AAASQ9NRG9 546 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 ASIC3Q9UHC3 531 aa25.26■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PMS1-205ENST00000409985 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.25■■□□□ 1.63
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