RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MROH2AA6NES4 1674 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 POLE2P56282 527 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ESRRGP62508 458 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP73A6NFT4 308 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 SV2CQ496J9 727 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MORF4L2Q15014 288 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.14■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ITGB3P05106 788 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SCFD2Q8WU76 684 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GPRASP2Q96D09 838 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ADA2Q9NZK5 511 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TRABDQ9H4I3 376 aa22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ARP10275 920 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DEUP1Q05D60 604 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 STAT4Q14765 748 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 34.3
SMURF1-201ENST00000361125 AMHR2Q16671 573 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 RFX8Q6ZV50 586 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 KLK14Q9P0G3 267 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CHN1P15882 459 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 IRAK1P51617 712 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.133e-7■■■□□ 17.3
SMURF1-201ENST00000361125 GGT7Q9UJ14 662 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP69A5D8W1 941 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 OR1G1P47890 313 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ORC1Q13415 861 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 HPDLQ96IR7 371 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 E2F8A0AVK6 867 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GRIN3BO60391 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CYP11B2P19099 503 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 LSP1P33241 339 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 MTM1Q13496 603 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PCSK7Q16549 785 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC7Q99615 494 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM247A6NEH6 219 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 E2F6O75461 281 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 AGTP01019 485 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PGK2P07205 417 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGDIAP52565 204 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 FGFR2P21802 821 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 LAMC2Q13753 1193 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DCAF6Q58WW2 860 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 C9orf72Q96LT7 481 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 STMN1P16949 149 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 RAD51Q06609 339 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 GNASQ5JWF2 1037 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 FAM161BQ96MY7 647 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM253P0C7T8 217 aa22.11■■□□□ 1.13
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