RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.89□□□□□ -0.99
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GINS3-210ENST00000568468 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 CLCN6P51797 869 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 NEUROD1Q13562 356 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.87□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 SPOCK2Q92563 424 aa8.87□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 MROH2AA6NES4 1674 aa8.87□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 DEPDC5O75140 1603 aa8.87□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 ZMYM3Q14202 1370 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 ABCC3O15438 1527 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 C3P01024 1663 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 RASEFQ8IZ41 740 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.86□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 GABBR2O75899 941 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 KLHL34Q8N239 644 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 NPATQ14207 1427 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 CEP152O94986 1710 aa8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.84□□□□□ -0.99
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GINS3-210ENST00000568468 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.83□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.83□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 PLA2R1Q13018 1463 aa8.83□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.82□□□□□ -1
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GINS3-210ENST00000568468 TET3O43151 1660 aa8.81□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.81□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.8□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.8□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.8□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.8□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.8□□□□□ -1
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GINS3-210ENST00000568468 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
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GINS3-210ENST00000568468 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 PTPRTO14522 1441 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 ERVK-7P63135 1459 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 RGL3Q3MIN7 710 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 PHF12Q96QT6 1004 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-210ENST00000568468 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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GINS3-210ENST00000568468 TNRQ92752 1358 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 TONSLQ96HA7 1378 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 HSPA2P54652 639 aa8.77□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 NOS1P29475 1434 aa8.77□□□□□ -1.01
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GINS3-210ENST00000568468 CLTCL1P53675 1640 aa8.76□□□□□ -1.01
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GINS3-210ENST00000568468 SYNMO15061 1565 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 NLRP1Q9C000 1473 aa8.76□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 IDI1Q13907 227 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 FAM212AQ96EL1 285 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.75□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 GSE1Q14687 1217 aa8.74□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.72□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.71□□□□□ -1.01
GINS3-210ENST00000568468 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.71□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 STRCQ7RTU9 1775 aa8.71□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 KIF12Q96FN5 646 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 ADGRB3O60242 1522 aa8.7□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 PIK3C2BO00750 1634 aa8.69□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.68□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 SLIT1O75093 1534 aa8.67□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.67□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.67□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.67□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.67□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.67□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.66□□□□□ -1.02
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