RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA2Q08379 1002 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRB-210ENST00000551525 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-210ENST00000551525 GSE1Q14687 1217 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-210ENST00000551525 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 EVC2Q86UK5 1308 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 PDE3BQ13370 1112 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 AIDAQ96BJ3 306 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.87□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 MIA2Q96PC5 1412 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 CASC1Q6TDU7 716 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 BECN1Q14457 450 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 RXRBP28702 533 aa7.86□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 MRS2Q9HD23 443 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC15P60006 121 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 WDR62O43379 1518 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-210ENST00000551525 NCOA2Q15596 1464 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-210ENST00000551525 PHF14O94880 888 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
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PTPRB-210ENST00000551525 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 HFM1A2PYH4 1435 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 FANCAO15360 1455 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 ROCK1Q13464 1354 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 MIER1Q8N108 512 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 MSH6P52701 1360 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 KIF14Q15058 1648 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRL1O94910 1474 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRB-210ENST00000551525 E9PSI1 815 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA2P54652 639 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 STK31Q9BXU1 1019 aa7.79□□□□□ -1.16
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR162Q16538 588 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 RALBP1Q15311 655 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 PRXQ9BXM0 1461 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.77□□□□□ -1.16
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.77□□□□□ -1.17
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