RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 TMC1Q8TDI8 760 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 MSH6P52701 1360 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP1Q9C000 1473 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-206ENST00000548122 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-206ENST00000548122 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-206ENST00000548122 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-206ENST00000548122 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 ADGRL2O95490 1459 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 ERVK-7P63135 1459 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-206ENST00000548122 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-206ENST00000548122 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-206ENST00000548122 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-206ENST00000548122 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRB-206ENST00000548122 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 ADAMTS2O95450 1211 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRB-206ENST00000548122 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRB-206ENST00000548122 PTPRTO14522 1441 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRB-206ENST00000548122 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
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PTPRB-206ENST00000548122 EVC2Q86UK5 1308 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 TMF1P82094 1093 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 CEP152O94986 1710 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 EVA1CP58658 441 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 C3P01024 1663 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 PLA2R1Q13018 1463 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.5□□□□□ -1.21
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