RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KLK14	Q9P0G3	267 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MTRR	Q9UBK8	725 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CDH7	Q9ULB5	785 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	USP20	Q9Y2K6	914 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		5	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	WIPF1	O43516	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NEMF	O60524	1076 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TADA2A	O75478	443 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	RECQL4	O94761	1208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ABLIM3	O94929	683 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MYB	P10242	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MUT	P22033	750 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PROZ	P22891	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NAMPT	P43490	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GPC5	P78333	572 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NTHL1	P78549	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	UPP1	Q16831	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DAW1	Q8N136	415 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FGF13	Q92913	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNN1	Q92952	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CLDN23	Q96B33	292 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	N4BP3	O15049	544 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MARCH6	O60337	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRN2	O75325	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PRKCB	P05771	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TH	P07101	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	C8A	P07357	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SP9	P0CG40	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TDGF1	P13385	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FCAR	P24071	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	OR1D2	P34982	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MAPK7	Q13164	816 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PDIA5	Q14554	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PSMD5	Q16401	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	IL17A	Q16552	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MAPK6	Q16659	721 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749		Q6ZVU0	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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