RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 BEST2Q8NFU1 509 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 SEL1LQ9UBV2 794 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 FBXL5Q9UKA1 691 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MAFFQ9ULX9 164 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ANHXE9PGG2 379 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 CFHP08603 1231 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 PAX3P23760 479 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 STAT6P42226 847 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 TCF15Q12870 199 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 STK38Q15208 465 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB6Q15916 424 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ADALQ6DHV7 355 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ELMOD1Q8N336 334 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 FGF13Q92913 245 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 HVCN1Q96D96 273 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 USP28Q96RU2 1077 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MYH11P35749 1972 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 WDR27A2RRH5 827 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 TBC1D4O60343 1298 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 PTPN2P17706 415 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MRE11P49959 708 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 HTR4Q13639 388 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 POSTNQ15063 836 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 SFR1Q86XK3 245 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 FIZ1Q96SL8 496 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 DERAQ9Y315 318 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.98■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 M0QZQ0 153 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ADRB2P07550 413 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 CPB1P15086 417 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 SPATA1Q5VX52 437 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 HSCBQ8IWL3 235 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ITFG1Q8TB96 612 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 SNX21Q969T3 373 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 PANK2Q9BZ23 570 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ASB7Q9H672 318 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.97■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 MYMKA6NI61 221 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ZNF197O14709 1029 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 FAM189A1O60320 539 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 OAZ2O95190 189 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 RHOP08100 348 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 IDEP14735 1019 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ACOT2P49753 483 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ADCY1Q08828 1119 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 JADE1Q6IE81 842 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 IQCEQ6IPM2 695 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 ACCSQ96QU6 501 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 CA14Q9ULX7 337 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 TRIP11Q15643 1979 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 CITO14578 2027 aa21.96■■□□□ 1.11
DDB1-220ENST00000542337 AOC1P19801 751 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 PARM1Q6UWI2 310 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 GDE1Q9NZC3 331 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 VWA8A3KMH1 1905 aa21.95■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 OR6C75A6NL08 312 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 H0Y858 1186 aa21.94■■□□□ 1.1
DDB1-220ENST00000542337 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms