RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541503.1

ERC1-211, Transcript of ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene ERC1, Length 531 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1-211ENST00000541503 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ERC1-211ENST00000541503 IPPQ9Y573 584 aa5.84□□□□□ -1.47
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ERC1-211ENST00000541503 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 TYRP1P17643 537 aa5.83□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 TGM1P22735 817 aa5.83□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 MPLP40238 635 aa5.83□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 AVPR1BP47901 424 aa5.83□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 COQ10AQ96MF6 247 aa5.82□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.82□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 PPFIA2O75334 1257 aa5.81□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 ALDH1L1O75891 902 aa5.81□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 FDXRP22570 491 aa5.81□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 SLC16A1P53985 500 aa5.81□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 PTPN21Q16825 1174 aa5.81□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.81□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.81□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 VAV2P52735 878 aa5.79□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 Q6ZNX1 250 aa5.79□□□□□ -1.48
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ERC1-211ENST00000541503 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.78□□□□□ -1.48
ERC1-211ENST00000541503 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
ERC1-211ENST00000541503 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ERC1-211ENST00000541503 CCND1P24385 295 aa5.77□□□□□ -1.49
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